pyoverdine I (PAMDB120298)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 1/22/2018 12:54:54 PM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite ID | PAMDB120298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name: | pyoverdine I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description: | Pyoverdine I (PVDI) is the type of pyoverdine that is synthesized by Pseudomonas aeruginosa . The molecule is composed from the common chromophore (synthesized from GLT, TYR and L-2,4-diaminobutanoate), connected to an octapeptide consisting of D-SERINE- ARG- D-SERINE- N5-formyl-N5-hydroxy-L-ornithine-c( LYS- N5-formyl-N5-hydroxy-L-ornithine- THR- THR). The last four amino acids form a cycle. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms: |
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Chemical Formula: | C56H88N18O22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight: | 1365.419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight: | 1364.6321 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key: | QIRRYPHVUMPBDX-UARRTFJPSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI: | InChI=1S/C56H88N18O22/c1-27(79)43-53(91)61-15-4-3-8-31(46(84)65-34(11-7-19-73(96)26-78)49(87)70-44(28(2)80)54(92)71-43)64-47(85)33(10-6-18-72(95)25-77)67-50(88)36(23-75)68-48(86)32(9-5-16-62-56(58)59)66-51(89)37(24-76)69-52(90)38-14-17-60-45-35(63-42(83)13-12-30(57)55(93)94)20-29-21-40(81)41(82)22-39(29)74(38)45/h20-22,25-28,30-34,36-38,43-45,60,75-76,79-82,95-96H,3-19,23-24,57H2,1-2H3,(H,61,91)(H,63,83)(H,64,85)(H,65,84)(H,66,89)(H,67,88)(H,68,86)(H,69,90)(H,70,87)(H,71,92)(H,93,94)(H4,58,59,62)/t27?,28?,30?,31?,32?,33?,34?,36?,37?,38-,43?,44?,45?/m0/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS number: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional IUPAC Name: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES: | CC(O)C1(NC(C(NC(=O)C(CCCN(C=O)O)NC(=O)C(CCCCNC(=O)1)NC(=O)C(CCCN(C=O)O)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(NC(C(CO)NC(C4(CCNC3(C(NC(CCC(C(=O)O)N)=O)=CC2(C=C(O)C(O)=CC=2N34))))=O)=O)CCCNC(=N)N)C(C)O)=O) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy Description | This compound belongs to the class of organic compounds known as oligopeptides. These are organic compounds containing a sequence of between three and ten alpha-amino acids joined by peptide bonds. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Carboxylic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Amino acids, peptides, and analogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Oligopeptides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aromatic heteropolycyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Charge: | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Melting point: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways: |
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Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
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