4-Amino-2-methyl-5-phosphomethylpyrimidine (PAMDB000932)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 1/22/2018 12:54:54 PM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite ID | PAMDB000932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name: | 4-Amino-2-methyl-5-phosphomethylpyrimidine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description: | 4-amino-2-methyl-5-phosphomethylpyrimidine is a member of the chemical class known as Pyrimidines and Pyrimidine Derivatives. These are compounds containing a pyrimidne ring, which is a six-member aromatic heterocycle which consists of two nitrogen atoms (at positions 1 and 3) and four carbon atoms. Tomato LeTHIC is an Fe-requiring HMP-P synthase involved in thiamine synthesis and regulated by multiple factors. (PMID 21511719) Although each isoform independently can synthesize HMP pyrophosphate (HMP-PP) from HMP, there is a marked difference in efficiency between the two proteins. (PMID 15614489) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms: |
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Chemical Formula: | C6H8N3O4P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight: | 217.122 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight: | 217.026339907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key: | PKYFHKIYHBRTPI-UHFFFAOYSA-L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI: | InChI=1S/C6H10N3O4P/c1-4-8-2-5(6(7)9-4)3-13-14(10,11)12/h2H,3H2,1H3,(H2,7,8,9)(H2,10,11,12)/p-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS number: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name: | [(6-imino-2-methyl-1,6-dihydropyrimidin-5-yl)methoxy]phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional IUPAC Name: | (4-imino-2-methyl-3H-pyrimidin-5-yl)methoxyphosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES: | CC1=NC=C(COP([O-])([O-])=O)C(=N)N1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy Description | This compound belongs to the class of organic compounds known as aminopyrimidines and derivatives. These are organic compounds containing an amino group attached to a pyrimidine ring. Pyrimidine is a 6-membered ring consisting of four carbon atoms and two nitrogen centers at the 1- and 3- ring positions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organoheterocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Diazines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Pyrimidines and pyrimidine derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Aminopyrimidines and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aromatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Charge: | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Melting point: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties: |
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Predicted Properties |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations: | Cytoplasm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions: | 2-Methyl-4-amino-5-hydroxymethylpyrimidine diphosphate + Water > 4-Amino-2-methyl-5-phosphomethylpyrimidine + Hydrogen ion + Phosphate 4-Amino-5-hydroxymethyl-2-methylpyrimidine + Adenosine triphosphate <> 4-Amino-2-methyl-5-phosphomethylpyrimidine + ADP + Hydrogen ion + 4-amino-5-phosphonooxymethyl-2-methylpyrimidine 4-Amino-2-methyl-5-phosphomethylpyrimidine + Adenosine triphosphate > 2-Methyl-4-amino-5-hydroxymethylpyrimidine diphosphate + ADP 5-Aminoimidazole ribonucleotide + Water + NAD > 4-Amino-2-methyl-5-phosphomethylpyrimidine +2 Formic acid +3 Hydrogen ion + NADH Adenosine triphosphate + 4-Amino-5-hydroxymethyl-2-methylpyrimidine <> ADP + 4-Amino-2-methyl-5-phosphomethylpyrimidine 4-Amino-5-hydroxymethyl-2-methylpyrimidine + S-Adenosylmethionine <> 5-Aminoimidazole ribonucleotide + 4-Amino-2-methyl-5-phosphomethylpyrimidine + 5'-Deoxyadenosine + L-Methionine + Formic acid + CO Adenosine triphosphate + 4-Amino-5-hydroxymethyl-2-methylpyrimidine <> Hydrogen ion + ADP + 4-Amino-2-methyl-5-phosphomethylpyrimidine 5-Aminoimidazole ribonucleotide + S-Adenosylmethionine 4-Amino-2-methyl-5-phosphomethylpyrimidine + 5'-Deoxyadenosine + L-Methionine + Formic acid + carbon monoxide + Hydrogen ion | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra: |
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References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References: |
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Synthesis Reference: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
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