2-Phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol (PAMDB000898)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 1/22/2018 12:54:54 PM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite ID | PAMDB000898 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name: | 2-Phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description: | 2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-c-methyl-D-erythritol is a member of the chemical class known as Pyrimidine Ribonucleoside Diphosphates. These are pyrimidine ribobucleotides with diphosphate group linked to the ribose moiety. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms: |
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Chemical Formula: | C14H22N3O17P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight: | 597.257 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight: | 597.018401574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key: | HTJXTKBIUVFUAR-XHIBXCGHSA-J | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI: | InChI=1S/C14H26N3O17P3/c1-14(6-18,33-35(23,24)25)8(19)5-31-37(28,29)34-36(26,27)30-4-7-10(20)11(21)12(32-7)17-3-2-9(15)16-13(17)22/h2-3,7-8,10-12,18-21H,4-6H2,1H3,(H,26,27)(H,28,29)(H2,15,16,22)(H2,23,24,25)/p-4/t7-,8-,10-,11-,12-,14+/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS number: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name: | {[(2S,3R)-4-({[({[(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(2-hydroxy-4-imino-1,4-dihydropyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl)oxy](hydroxy)phosphoryl}oxy)-1,3-dihydroxy-2-methylbutan-2-yl]oxy}phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional IUPAC Name: | [(2S,3R)-4-[({[(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(2-hydroxy-4-iminopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy(hydroxy)phosphoryl}oxy(hydroxy)phosphoryl)oxy]-1,3-dihydroxy-2-methylbutan-2-yl]oxyphosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES: | [H][C@@](O)(COP(O)(=O)OP([O-])(=O)OC[C@@]1([H])O[C@@]([H])(N2C=CC(=N)N=C2[O-])[C@]([H])(O)[C@]1([H])O)[C@](C)(CO)OP([O-])([O-])=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy Description | This compound belongs to the class of organic compounds known as pyrimidine ribonucleoside diphosphates. These are pyrimidine ribobucleotides with diphosphate group linked to the ribose moiety. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Nucleosides, nucleotides, and analogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Pyrimidine nucleotides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Pyrimidine ribonucleotides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Pyrimidine ribonucleoside diphosphates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aromatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Charge: | -4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Melting point: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties: |
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Predicted Properties |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations: | Cytoplasm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions: | 2-Phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol <> 2-C-Methyl-D-erythritol-2,4-cyclodiphosphate + Cytidine monophosphate 4-(Cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol + Adenosine triphosphate <> 2-Phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol + ADP 4-(Cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol + Adenosine triphosphate > Hydrogen ion + 2-Phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol + ADP 2-Phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol > 2-C-Methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate + Cytidine monophosphate 4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol + Adenosine triphosphate + 4-(Cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol > Adenosine diphosphate + Hydrogen ion + 2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol + ADP + 2-Phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol 2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol + 2-Phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol > Cytidine monophosphate + 2-C-Methyl-D-erythritol-2,4-cyclodiphosphate + Cytidine monophosphate 2-Phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol + 2-Phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol > 2-C-Methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate + Cytidine monophosphate + Cytidine monophosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra: |
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References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References: |
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Synthesis Reference: | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links: |
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